Μετά από μια μεγάλη μάχη το πλοίο Ανδρομέδα παγιδευεται σε μια μαύρη τρύπα κρατώντας μόνο τα βασικά συστήματα λειτουργίας ανοιχτά. Όταν ο Διοικητής Χαντ ξυπνά, βρισκόμενος απο κρυογεννετικη κατάσταση για 300 χρόνια, αντιλαμβάνεται ότι η μάχη που έχασε ήταν η αρχή ενός επικού πόλεμου που οδήγησε σε πτώση του Πολιτισμού και σε διάλυση της Συνομοσπονδίας την οποία υπερασπιζοταν. Αυτός και το απρόβλεπτο πλήρωμα του ξεκινάνε σαν αποστολή να επαναφέρουν την τάξη και το πολιτισμό σε όλον το γνωστό κόσμο.