继杰森·伯恩后，另一美国中情局特工艾伦·克劳斯（杰瑞米·雷纳 饰）亦将身陷险境。因为“杰森·伯恩事件”，令中情局的特工行动“绊脚石”被公开，为了隐瞒其它特工行动，以拜亚（爱德华·诺顿饰）为首的美国中情局，正计划铲除过去数十年来发展的特工行动，包括对“结果”行动当中，体能和智能更“先进”的“5号”特工艾伦·克劳斯，展开横跨全球的逃杀。而艾伦·克劳斯剩下的唯一希望，竟然就是过去四年来，不断在背后监控和研究其活动的科学研究员玛泰博士（蕾切尔·薇兹 饰）……