真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练宝可梦的资格。10岁的少年小智以成为最厉害的宝可梦大师为目标，即将踏上修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选最初的宝可梦的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的宝可梦——皮卡丘。皮卡丘又名电鼠，虽然长相可爱，但性格含羞内向却又不亲近人类，稍有不满就乱放电电人，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。大木博士把宝可梦图鉴和精灵球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘的前方，宝可梦的世界有许多谜题和探险在等着他们，迎接他们的到底是光明还是黑暗，小智能否如愿成为宝可梦大师呢？